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Emplois :

 

1151 – Research Associate 2 - Ethanol Fermentation

 

Scope

               

Iogen Corporation is seeking an experienced scientist to lead a small research team involved in a laboratory program which will improve and advance Iogen’s ethanol fermentation technology.  A fundamental understanding of yeast physiology and eukaryotic metabolism, in addition to bench scale fermentation and previous supervisory experience, are all requirements for this position. 

 

Duties & Responsibilities:

 

·              Under the direction of the Fermentation Group Leader, contributes to the development of strategies to advance and improve our technology platform for the fermentation of sugars to ethanol.

·              Assumes the lead role in managing the fermentation research portfolio defined for their area, which will include both the design, execution and reporting of their own projects, in addition to the supervisory responsibility for 2-3 junior staff.

·              Experiments are typically carried out in shake-flasks or pilot fermentors but there is also an expectation to assist a larger team in the evaluation of performance of the large scale fermentation operation in Iogen’s demonstration plant. 

·              Analyzes samples using techniques such as GC, HPLC, cell mass analysis, microscopy, enzyme activity, fermentability and plate assay

·              Participates in coordination of projects with consultants and collaborators. 

 

Qualifications:

 

·              M.Sc in Biotechnology, Biochemistry or Microbiology with a minimum of 3 years relevant work experience OR B.Sc. in Biotechnology, Biochemistry with a minimum of 5 years of fermentation experience. 

·              Minimum 2 years of experience supervising full time laboratory staff is required.  Project and performance management experience will be an asset.

·              Experience with genetic engineering techniques, cell culture, requirements for cell growth and common analysis techniques to phenotypically characterize microorganisms are required.

·              Demonstrate a thorough fundamental understanding of yeast metabolism, redox metabolism and conversion routes for pentose sugars.

·              Intermediate to advanced Excel spreadsheet skills are required and experience working with kinetic models will be an asset.

 

To apply to this position or view other exciting Iogen opportunities, please go to our website at

www.iogen.ca

 

1176 - Staff Scientist – Pentose Fermentation

 

Scope

               

Iogen Corporation is seeking an experienced scientist to take a leading role in pentose fermentation research under the direction of the Fermentation Group Leader.  He/She will become the leading expert in the company in this area, supervise a small research team conducting research in the fermentation of sugars to valuable products and provide (experimental) support in the design of a commercial-scale cellulose ethanol plant.  A fundamental understanding of yeast physiology, eukaryotic (redox) metabolism, bench scale fermentation, pervious supervisory experience and good communication skills are essential for this position.

 

Iogen is located in Ottawa, Canada.  Relocation and immigration assistance would be provided

 

Duties & Responsibilities:

  • Assumes a leading role in the development of strategies to advance and improve our technology platform for fermentation of pentose sugars to valuable products.
  • Manages the fermentation research portfolio defined for their area, which includes:
  • Demonstrates creative problem solving skills and accountability for meeting project timelines
  • Provides technical guidance to staff in identifying technical risks, designing, scheduling and carrying out projects, in addition to mentoring the staff by identifying targets for growth, setting goals and managing performance.
  • Participates in coordination of outside consultants and collaborations.

Qualifications:

  • Ph.D. or equivalent in Biochemistry, Biology, Microbiology, Biotechnology or Biochemical Engineering with 4+ years experience in yeast fermentation and metabolic engineering
  • Minimum, 2 years experience supervising full time laboratory staff is required.
  • Strong background and expertise on the physiology of fermentative organisms including yeast and bacteria is vital.  This encompasses thorough knowledge and understanding of metabolic routes, and especially redox metabolism.
  • Demonstrated ability to link growth kinetics and physiological data to imposed environmental conditions (such as aeration and nutrient) using computer calculations and newly developed models is essential)
  • Project and performance management experience in addition to supervisory experience in an industrial environment is a significant asset.
  • Industrial experience in eukaryotic fermentations would also be considered an asset.

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Thèses :

 

Proposition de sujet de thèse

 

Identification des déterminants physico-chimiques et biologiques mis en jeu dans l’adhésion de Lactococcus lactis à la muqueuse intestinale

 

Laboratoire d’Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Toulouse

Laboratoire d’Analyse et d’Architecture des Systèmes (LAAS), Toulouse

 

Porteurs du projet : Muriel Mercier-Bonin, CR1 INRA – CEPIA, LISBP, équipe Génie du Métabolisme des Procaryotes et Etienne Dague, CR2 CNRS – ST2I, LAAS, groupe Nano-Biosystèmes

 

Financement (acquis) : bourse INRA

 

Objectifs et programme de travail

Mené en collaboration entre le Laboratoire d’Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP) et le Laboratoire d’Analyse et d’Architecture des Systèmes (LAAS), le projet sera focalisé sur la caractérisation du comportement de Lactococcus lactis, bactérie lactique considérée comme modèle dans l’industrie agro-alimentaire, vis-à-vis de son adhésion à la muqueuse intestinale. Ce projet s’inscrit dans une dynamique interdisciplinaire, face à des enjeux socio-économiques forts et dans un contexte scientifique riche, actuellement en phase de structuration à l’INRA (réseaux « Biofilms » et « Probiotiques »). Le travail envisagé relève des questions de recherche suivantes, à l’intersection de différents champs disciplinaires : quelles sont les capacités d’adhésion de L. lactis à la surface fonctionnalisée par adsorption de mucines et choisie comme modèle in vitro de muqueuse intestinale ? Dans quelle mesure les propriétés physico-chimiques globales de la bactérie permettent-elles d’expliquer sa capacité d’adhésion ? De quelle manière les interactions biologiques spécifiques sont-elles impliquées dans l’adhésion de L. lactis à la surface fonctionnalisée ? Connaissant les paramètres physico-chimiques et biologiques mis en jeu, comment la force d’adhésion peut-elle être modélisée ? Pour répondre à ces questions, le travail sera décliné selon trois volets principaux : (i) caractérisation des propriétés de surface de L. lactis, (ii) quantification de la force d’interaction L. lactis/surface fonctionnalisée : couplage d’une technique directe (microscopie à force atomique) et d’une technique indirecte (exposition à une force de cisaillement en chambre à écoulement cisaillé), avec des échelles d’observation macro-, micro- et nanoscopique, (iii) modélisation de la force d’interaction L. lactis/surface fonctionnalisée.

 

Résultats attendus

Ce projet permettra (i) d’identifier les déterminants physico-chimiques et biologiques impliqués dans l’adhésion de L. lactis - bactérie alimentaire modèle - à un modèle simplifié de muqueuse intestinale et (ii) de modéliser le(s) processus d’interaction. L’un des points forts et innovants réside dans la complémentarité et le couplage des différentes méthodologies déployées (chambre à écoulement cisaillé, spectroscopie de force par AFM) ainsi que dans la combinaison d’approches expérimentales et théoriques. Cette démarche interdisciplinaire aura pour finalité de dissocier les effets purement physico-chimiques de ceux liés spécifiquement à l’interaction mucine-surface microbienne, ouvrant ainsi de réelles opportunités pour la compréhension des mécanismes biologiques mis en jeu via l’identification des structures cellulaires impliquées (analyse transcriptomique, construction de mutants).

 

Bibliographie

Dague E., Alsteens D., Latge J.P., Dufrene Y., 2008, High-resolution cell surface dynamics of germinating Aspergillus fumigat us conidia, Biophys. J., 94, 1-5.

Guillemot G., Vaca-Medina G., Martin-Yken H., Vernhet H., Schmitz P. and Mercier-Bonin M., 2006, Shear-flow induced detachment of Saccharomyces cerevisiae from stainless steel: influence of yeast and solid surface properties, Colloid Surface B, 49, 126-135.

Redon E., Loubière P. and Cocaign-Bousquet M., 2005, Transcriptome analysis of the progressive adaptation of Lactococcus lactis to carbon starvation, J. Bacteriol., 187, 3589-3592.

 

Expérience souhaitée :

Le candidat devra avoir de solides compétences en physico-chimie des surfaces et, idéalement, en microbiologie. Compte-tenu du caractère interdisciplinaire du projet mené en collaboration étroite entre deux laboratoires, le candidat devra faire preuve de capacités d'autonomie et d'adaptation.

 

Personne à contacter : Muriel Mercier-Bonin (Muriel.Mercier-Bonin @ insa-toulouse.fr)

 

Post-Doctorats :

    

 

 

Sujets de Master :

 

 

Stage de 6 mois