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Dephine LABOURDETTEIngénieur d’Etudes en bioinformatique LISBP

Delphine LABOURDETTE
Ingénieur d’Etudes en bioinformatique
Plateforme GeT-Biopuces
+33 (0) 5-61-55-96-87
INSA de Toulouse
135 avenue de Rangueil
31077 Toulouse cedex 4 - FRANCE
delphine.labourdette@insa-toulouse.fr

 

CV

Depuis Octobre 2001

Ingénieur d’études - Plateforme GeT-Biopuces (Toulouse-31). Analyse d’image et exploitation des données de transcriptome d’études de Micro-Array ou de séquençage haut débit (RNA-seq).

Mars-Septembre 2001

Stage DESS Bioinformatique - Plateforme GeT-Biopuces (Toulouse-31). Analyse du transcriptome de la levure.

Février-Juin 2000

Stage DEA - Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale (Toulouse-31). Conception et étude d'analogues d'antigènes tumoraux résistants à la protéolyse.

Septembre 1999 - Février 2000

Stage DEA - Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale (Toulouse-31). Mise au point de l'interruption du gène de la nucléoline dans les cellules DT40.

Septembre-Octobre 1998

Stage de Maîtrise – Elf Exploration Production (Pau-64). Traitements statistiques et valorisation de données géochimiques

 

Formation

2001 DESS de BioInformatique (Toulouse III, 31)
2000 DEA de Biologie-Santé-Biotechnologie (Toulouse III, 31)
1999 Maîtrise de Biochimie (UPPA, 64)

 

RESEARCH TOPICS

Microarray

  • Conseiller / Former le client sur les analyses d’images
  • Maitriser les logiciels d’analyse d’image associés aux lecteurs de puces
  • Effectuer les analyses d’images de biopuces
  • Effectuer les contrôles qualité nécessaire à l’obtention du produit conforme

NGS (Séquençage de nouvelles générations)

  • Planifier / effectuer les analyses de séquences (nettoyage, mapping…) des données de séquençage transcriptomiques (RNAseq)
  • Conseiller le client sur les analyses
  • Effectuer les contrôles qualité nécessaire à l’obtention du produit conforme

 

TEACHING

Formation des utilisateurs aux technologies et appareils d’analyse d’image de la plateforme GeT-Biopuces.
Formation à l'analyse d'expression des gènes codant pour des protéines en utilisant des séquences de type RNA-Seq, en collaboration avec la plateforme BioInfo de toulouse.

 

PUBLICATIONS

Beltran G, Novo M, Leberre V, Sokol S, Labourdette D, Guillamon JM, Mas A, Francois J, Rozes N.
Integration of transcriptomic and metabolic analyses for understanding the global responses of low- temperature winemaking fermentations. FEMS Yeast Res. 2006 Dec;6(8):1167-83.
Lagorce A, Hauser NC, Labourdette D, Rodriguez C, Martin-Yken H, Arroyo J, Hoheisel JD, Francois J.
Genome-wide analysis of the response to cell wall mutations in the yeast Saccharomyces cerevisiae. J Biol Chem. 2003 May 30;278(22):20345-57.