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Véronique LE BERREDirectrice adjointe du LISBP

Véronique Le Berre - Anton
Chargé de Recherche CNRS

Directrice adjointe du LISBP
Responsable de l’équipe Biopuces Bio-nanotechnologies et de la plateforme GeT-Biopuces

INSA de Toulouse
135 avenue de Rangueil
31077 Toulouse cedex 4 - FRANCE
leberre@insa-toulouse.fr
site web : http://biopuce.insa-toulouse.fr/
http://get.genotoul.fr/index.php

 

CV

Après une thèse effectuée à l’Institut de Pharmacologie et Biologie Structurale du CNRS sur l’étude fonctionnelle et structurale de l’inhibiteur de l’amylase isolé du haricot phaseolus vulgaris, j’ai effectué un post-doctorat au laboratoire de Biotechnologie - Bioprocédé sur l’étude de mutants la paroi de Saccharomyces cerevisiae. Ensuite, j’ai été engagée début 2000 en tant que responsable de la plate-forme Biopuces, puis en 2001 passé le concours de CR2 CNRS sur le développement de Biopuces de nouvelles générations.
La plateforme Biopuces a été créée dans le cadre de la Génopôle Toulouse Midi Pyrénées. Elle est spécialisée dans la production, l'analyse et le développement de biopuces à ADN et à protéines. Elle fournit aux utilisateurs tout l’équipement et l'expertise d'une équipe multidisciplinaire pour produire des biopuces et mener des expériences de transcriptomique (ARNm et micro ARN), de génotypage (CGH-arrays), d’analyse de la régulation de l'expression des gènes (épigénétique) ou d’interactions protéiques et ce sur divers systèmes biologiques (microbiens, plantes, animaux, humains), touchant les domaines de la santé humaine, santé animale, microbiologie, agronomie et environnement.
Cette plateforme a été conçue pour réaliser deux missions :
l’une de service, avec la mise à disposition des laboratoires publics et privés, des outils et expertises permettant de conduire des expériences d’hybridation sur lames de verre. Cette mission de services fonctionne selon des modalités précises, relevant d’un cahier des charges et de contrôles qualité détaillés et spécifiques à chaque projet.
l’autre mission est une mission de recherche et développement. Pour cette activité la plate-forme travaille dans un cadre pluridisciplinaire, impliquant des équipes spécialisées en Nano et Microtechnologie du Laboratoire d'Analyse et d'Architecture des Systèmes (LAAS du CNRS) et de l’ITAV et en chimie des acides nucléiques du laboratoire de Chimie de Coordination (LCC/CNRS) sur des programmes de développement technologiques de bio-puces de nouvelle génération.

 

RESEARCH TOPICS

Mes activités de recherche se focalisent sur trois axes majeurs. Il s’agit de (1) la technologie de dépôt, (2) la détection directe des interactions moléculaires, (3) la technologie de greffage stable des biomolécules sur support.

De plus, je mets au point des outils de type ‘biopuces’ dans le cadre de projets de collaboration avec des partenaires biologiques (publics ou privés) ayant comme objectif final de disposer de ‘méthode de criblage’ ou de diagnostic rapide et sensible.

 

TEACHING

  • Depuis 2004, j’interviens dans les Travaux Pratiques de Post-Génomique. Ces TP sont divulgués aux étudiants de 5eme année de l’INSA et consistent en une initiation aux puces à ADN depuis la fabrication, l’utilisation des bio-puces jusqu’au traitement des données obtenues.
  • Dans le cadre de la formation professionnelle continue dispensée par le CRITT Bio-industrie nous avons mis en place depuis Octobre 2002 un stage sur l’utilisation des puces à ADN dont je suis la responsable. Ce stage s’adresse à des ingénieurs, chercheurs et techniciens souhaitant s’initier à la technologie des bio-puces et se déroule sur 5 jours.
  • Je participe depuis 2005, dans le cadre du Master Pro ‘Bio-ingénieurie’ et du Master Recherche ‘Biologie Santé et Biotechnologie’, filière 2 ‘Biologie Moléculaire Cellulaire et du Développement’ à la formation théorique des étudiants sur la technologie des puces et leurs applications.
  • J'ai donnée en 2005, 2006, 2008, 2009 et 2010 une conférence à la faculté des sciences et techniques de Limoges dans le cadre du Master Professionnel Biotechnologie de Limoges. Titre : Technologie des puces à ADN et exemple concret d’utilisation.
  • Depuis 2004, je dispense une formation initiation aux techniques des puces à ADN aux étudiants en thèse dans le cadre de l’ecole doctorale Biologie Sante Biotechnologies (BSB) de Toulouse. Cette formation se déroule sur 5 jours.
  • Depuis 2007 nous avons mis en place dans le cadre du Master Pro M2P 'Diagnostic Microbiologique" de Toulouse une formation de 2 semaines sur la mise en place d’une puce de détection bactérienne.

 

PUBLICATIONS

- Anton V., Rougé P., & Daffé M. (1996) Identification of the sugars involved in mycobacterial cell aggregation. FEMS Microbiol. Lett. 144, 167-170.
- Le Berre-Anton V., Bompard-Gilles C., Payan F. & RougE P. (1997) Characterisation and functional properties of the α-amylase inhibitor (α-AI) from the kidney bean (Phaseolus vulgaris) seeds. Biochimica et Biophysica Acta 1343, 31-40.
- Koukiekolo R., Le Berre-Anton V., Desseaux V., Moreau Y., Rouge P., Marchis-Mouren G., & Santimone M. (1999). The mechanism of porcine pancreatic -amylase: Inhibition of amylose and maltopentaose hydrolysis by kidney bean (Phaseolus vulgaris) inhibitor. Eur J Biochem. 1;265(1):20-6.
- Nahoum V., Farisei F., Le Berre-Anton V., Egloff M.P., Rouge P., Poerio E., & PAYAN F.(1999) A plant seed inhibitor of two classes of alpha-amylases. X-ray analysis of Tenebrio molitor larvae -amylase in complex with the bean Phaseolus vulgaris inhibitor. Acta Cristallographica section D, D 55, pp. 360-362.
- Nahoum V., Roux G., Anton V., Rougé P., Puigserver A., Bischoff H., Henrissat B. & Payan F.(2000) Crystal structure of human pancreatic alpha-amylase in complex with carbohydrate and proteinaceous inhibitors. Biochem J. 15, 201-208.
- Millot C., Le Berre-Anton V., Tocane J.F., Tournier J.F. (2000) Plasma membrane coating with cationic silica particles and osmotic shock alters the morphology of bovine aortic endothelial cells. Biochimica et Biophysica Acta 147, 85-90.
- Le Berre-Anton V., Nahoum v., Payan F., & RougE P. (2000) Molecular basis for the specific binding of different -amylase inhibitors from kidney bean (Phaseolus vulgaris) seeds to the active site of -amylase . Plant Physiol. Biochem. 38, 657-665.
- Lagorce A, Le Berre-Anton V, Aguilar-Uscanga B, Martin-Yken H, Dagkessamanskaia A, Francois J. (2002) Involvement of GFA1, which encodes glutamine-fructose-6-phosphate amidotransferase, in the activation of the chitin synthesis pathway in response to cell-wall defects in Saccharomyces cerevisiae. Eur J Biochem. Mar;269(6):1697-707.
- Belaubre P., Guirardel M., Leberre V., Dagkessamanskaia A., Trévisiol E., François J.M., Pourciel J.B., Garcia G., and Bergaud C. (2003) Fabrication of biological microarrays using microcantilevers", Applied Physics Letters 82, (18): 3122-3124.
- Le Berre, V., Trevisiol, E., Dagkessamanskaia, A., Sokol, S., Caminade, A.M., Majoral, JP, Meunier, B. and François, J. (2003) Dendrimeric coating of glass slides for sensitive DNA microarrays analysis. Nucleic Acids Research, vol 31, N° 16 1-8.
- Trévisiol E., Le Berre-Anton V., Leclaire J., Pratviel G., Caminade A.M., Majoral J.P., François J.M., and Meunier B.(2003) Dendrislides, Dendrichips: a Simple Chemical functionalization of glass slides with Phosphorus Dendrimers as an effective Mean for the Preparation of Biochips". New J. Chem., 27, 1713 – 1719.
- Santimone M., Koukiekol R., Moreau Y., Le Berre V., Rougé P., Marchis-Mouren G. and Desseaux V.(2003) Porcine pancreatic -amylase inhibition by the kidney bean (Phaseolus vulgaris) inhibitor (-AI1) and structural changes in the -amylase inhibitor complex. Biochimica et Biophysica Acta 1696 – 181 – 190.
- Beltran G, Novo M, Dagkesamansakaia A, Leberre V, Guillamon JM, Mas A, Francois J, Rozes N (2003). Functional genomics of wine yeast strain during industrial fermentation process at low temperature. YEAST. 20: S342-S342.
- Belaubre P., Guirardel M., Le Berre V., Pourciel J.B. & Bergaud C. (2004) Cantilever-based microsystem for contact deposition of pivoliter biological samples. Sensors and Actuators: Physics A Issues 1-3, Vol.110, pp.130-135
- Malaquin L., Vieu C., Geneviève M., Tauran Y., Carcenac F., Pourciel M. L., Leberre V. and Trévisiol E. (2004) Nanoelectrode-based devices for electrical biodetection in liquid solution Microelectronic Engineering 73-74, 887-892
- Thibault C. *, Le Berre V. *, Casimirius S., Trévisiol E., François J.M., Vieu C. (2005) Direct microcontact printing of oligonucleotides for biochip applications. Journal of Nanobiotechnology 3:7.
* Co-auteurs à contribution égale.
- Chaize B., Nguyen M., Ruysschaert T., le Berre V., Trévisiol E., Caminade A.M., Majoral J.P., Pratviel G., Meunier B., Winterhalter M.,
and Fournier D., (2006) Microstructured Liposome Array, Bioconjugate chem., 17 (1), 245-247.
- Pérez-Carreón J., López-García C., Fattel-Fazenda S., Arce-Popoca E., Alemán-Lazarini L., Hernández-García S., Le Berre V., Sokol S., François J.M. and Villa-Treviño S. (2006) Gene expression profile related to the progression of preneoplastic nodules toward hepatocellular carcinoma in rats; NeoplasiaVolume 8, Issue 5, p373 – 383.
- Beltran G., Novo M., Leberre V., Sokol S., Labourdette D., Guillamon J.M., Mas A., Francois J., Rozes N. (2006) Integration of transcriptomic and metabolic analyses for understanding the global responses of low-temperature winemaking fermentations. FEMS Yeast Research. Dec;6(8):1167-83.
- Kuranda K., Leberre V., Sokol S., Palamarczyk G., François J. (2006) Investigating the caffeine effects in the yeast saccharomyces revisiae brings new insights into the connection between Tor, PKC and RAS/CAMP signalling pathways. Molecular Microbiology -. Sep;61(5):1147-66.
- Novo M., Beltran G., Rozes N. , José-Manuel Guillamon J.M., Le Berre V., François J. and Mas A. (2007) Early transcriptional response of wine yeast after rehydratation: osmotic shock and metabolic activation. FEMS Yeast Res. Mar;7(2):304-16.
- Marquez-Quinones, A., Paris, A., Roussel, B., Perez-Carreon, J., Leberre, V., François, J., Villa-Trevino, S. and Gueraud, F. (2007) Proteasome activity deregulation in LEC rat hepatitis : following the insights of transcriptomics analysis. OMICS, 11, 367-384.
- Leberre, V., Baranowski, E., Delplanche, M. Trouilh, L. and François, J. (2007) Detection of minority variants within bovine respiratory syncytial RNA virus population using oligonucleotide-based microarrays. J. Virol Method 148, 271 - 276.
- Guimarães, P, M. Le Berre, V., Sokol, S., François J., Teixeira, J.A. and Domingues, L. (2008) Comparative transcriptome analysis between original and evolved recombinant lactose-consuming Saccharomyces cerevisiae strains. Biotechnol. J. 3(12):1591-7
- Kuranda, K., Grabinska. K., Berges. T., Karst. F., Leberre. V., Sokol. S., Francois. J., Palamarczyk. G. (2009) The YTA7 gene is involved in the regulation of the isoprenoid pathway in the yeast Saccharomyces cerevisiae. FEMS YEAST RESEARCH 9(3), 381-390
- Cau J.C, Lalo H., Séverac C., Peyrade1 J.P., Trévisiol E., Leberre V., Francois J.M., Vieu C. (2009). Molecular analysis for medicine: a new technological platform based on nanopatterning and label free optical direction. Oncologie 11: 1–5.
- Anton-Leberre V., Haanappel E., Marsaud N., Trouilh L., Benbadis L., Boucherie H., Massou S. and François J.M. (2010). Exposure to high static or pulsed magnetic fields does not affect cellular processes in the yeast Saccharomyces cerevisiae. Bioelectromagnetics 31:28-38
-Beltran-Ramirez, O., Sokol, S., Le Berre, V., François J.M., & Villa-Trevino, S. (2010) An approach to the study of gene expression in hepatocarcinogenesis initiation. Translational Oncology 3: 142-148.
- Arellanes-Robledo, J., Salcido-Neyoy, M., Marquez-Quinones, A., Garcia-Roman, R.,
Beltran-Ramirez, O., Le Berre, V., Sokol, S., François, J. and Trevino-Villa, S. (2010) The
celecoxib modulation of gene expression includes the Stat5 reactivation in early rat
hepatocarcinogenesis. Anti-Cancer Drugs: 21: 411-422.
- Pillet F., Thilbault C., Bellon S., Maillart E., Trévisiol E., Vieu C., François J.M., Anton-Leberre V. (2010) Simple surface chemistry to immobilize DNA probes that significantly increases sensitivity and spots density of surface plasmon resonance imaging based microarray systems. Sensors and Actuators B. 147 : 87-92.
- Pillet F., Romera C., Trévisiol E., Bellon S., Teulade-Fichou M-P., François J.M., Pratviel G., Anton Leberre V. (2011). Surface Plasmon Resonance imaging (SPRi) as an alternative technique for rapid and quantitative screening of small molecules, useful in drug discovery.
Sensors & Actuators: B. Chemical. doi:10.1016/j.snb.2011.03.082
-Pillet F., Sanchez A., Lane Dave; Anton Leberre V., Bouet J-Y. (2011) Centromere Binding Specificity in assembly of the F Plasmid Partition Complex. Nucleic Acids Research, 1–10 doi:10.1093/nar/gkr457